Genetisk variation

Regeringen har givit Skogforsk ett uppdrag via Formas rörande skogsträdsförädling (regeringsbeslut Jo2008/1883). Inom ramen för detta har Skogforsk bett Dag Lindgren om assistans med ett avsnitt för att: "belysa vilka effekter som en ökad användning av förädlat plantmaterial kan komma att ha på den genetiska variationen och plantornas känslighet för skadegörare". Jag har börjat arbeta med ett enhetligt dokument. Texten i .htm här bli lite inaktuell i detaljer. Först gjorde jag delar i word, sen smälte jag ihop dem i ETT dokument, en kladd till detta ligger här!

Konsekvenser av skogsträdsförädling och fröplantager beträffande genetisk variation och skadegörare

Register
Förord 2
Register 4
Mekanismer som ändrar genetisk sammansättning 6
Genetisk variation 6
Samband mellan genetisk variation och skadegörare 10
Förädling och skadegörare 13
Naturlig genmigration (pollen och frö) 15
Genetisk jämvikt, utavel, heterosis 16
Effekten av urval på kvantitativ genetisk varians 17
Kan en till synes bra skog vara genetisk dålig? 21
Människans och civilisationens påverkan 21
Hur såg skogen ut förr? 23
Hur skiljer sig skogsbrukarens önskemål från den "naturliga" skogen? 24
Värdet av en hög skogsproduktion 26
Vems är problemet? 29
För- och nackdelar med genetisk variation i ett bestånd 30
Jämförelse förädling och genetisk variation med andra inslag i skogsbruket 31
Global warming 31
Den genetiska variationen i förädling och skog i den avlägsna oförutsebara framtiden 33
Hur olika är olika provenienser? 35
Omfattning av "medveten" genförflyttning för gran och tall 37
Hur mycket gran i Götaland är av utländsk härkomst? 38
Hur mycket gran i Götaland är av utländskt ursprung 39
Provenienshybrider 42
Genetisk struktur i naturliga bestånd 48
Finns genetisk variation mellan närliggande bestånd? 49
Hur välanpassad och lämplig är "lokalproveniensen"? 50
Är främmande granprovenienser riskabelt? 51
Svensk förädling av gran och tall bevarar genetisk variation 54
Klonskogsbruk 55
Fröplantageskogsbruk 57
Praktiska test 59
Den genetiska variationen på landskapsnivå 60
Får framtidens skogar få förfäder? 63
Fil5 slutar på 65 fi6 börjar på 66
Identifiering och statistik för skogsodlingsmaterial 66
Vet markägaren vilka genetiska material som finns i skogen? 70
Varför kan det vara bra att veta det faktiska materialet i skogen? 72
Tidigare "genetiska misstag", finns ett system för att evaluera misstag? 74
Bra att få erfarenhet av skogsbruk med låg genetisk variation 75 Den genetiska variationen i förädling och skog i den avlägsna oförutsebara framtiden 78
En levande diskussion, forskning och samordning om fröplantager 79
Referenser
Forskningsuppslag (Bilaga 1)
Uppslag som ligger inom eller nära den operativa förädlingen (Bilaga 2)
Uppslag för att lära känna den svenska skogen bättre (bilaga 3)
”MINT” projektet (bilaga 4)
Utredningsarbetet (bilaga 5)
Skogsgenetiska termer och ordförklaringar (bilaga 6)

Referensgrupp.
Till arbetet har knutits en referensgrupp bestående av Prof Martin Lascoux, Uppsala Universitet; Prof Nils Ryman, Stockholms Universitet; Prof Outi Savolainen, Uleåborgs Universitet. Referensgruppen har bl a via denna web tillgång till arbetet. Referensgruppen uppmanas att hjälpa till med länkar och med dokument de anser särskilt viktiga att studera, referensgruppen förväntas hjälpa till med att identifiera problem som bör belysas eller kommenteras. Referensgruppen uppmuntras att löpande kommentera arbetet, detta kan ske på engelska även om detta dokument huvudsakligen använder svenska. Referensgruppen förväntas löpande ge konstruktiva synpunkter på innehåll och slutsatser. Referensgruppen kan också tänkas ha förslag på någon jag skall kontakta.

Dag Lindgren: Professor i skogsgenetik vid Sveriges Lantbruksuniversitet sedan 1977. Dag Lindgren är landets enda professor i skogsgenetik och "fakultetsprofessor", dvs formellt den mest relevanta kompetensen i skogsgenetik som står till förfogande. Meriter och historia framgår av dokument på min web. Dag Lindgren pensionerades 090930.

Avgränsningar
Ej främmande arter, nästan enbart gran och tall (som helt dominerar skogsplantproduktionen av inhemska arter)
Svensk skog (och relevanta paralleller)

Diverse mer eller mindre relevanta länkar och dokument:
Finnvid Prescher, som har det direkta ansvaret för en väsentlig del av Sveriges fröförsörjning och ett betydande inflytande för hela, har en mycket hög kompetens, bla just för frågan om genetisk variation i förädlat frö. Detta minskar chansen att inflytandet på genetisk variation inte beaktas. 
En sammanställning av länkar omkring regelverk och plantanvändning
Gösta Eriksson med mfl. har författat Introduction to forest genetics (det står mycket bakgrund relevant för genetiskt variation) och en översikt av Tallforskning sedan 1990
Det organ hos skogsstyrelsen där problem med genetik och föryngring diskuteras är väl snarast centrala frö och plantrådet, som är ett rådgivande organ till skogsstyrelsen. http://www.svo.se/episerver4/templates/SNormalPage.aspx?id=33568
Diskussion 090519 skogsstyrelsen om främmande gener etc

Regeringsuppdrag till naturvårdsverket om genetisk variationGenetisk variation hos vilda växter och djur i Sverige

Studielitteratur till grundkursen i skogsvetarutbildningen Dag Lindgren 2006  Genetiska och legala aspekter på föryngringsmaterial
Föreläsning påbyggnadskurs för jägmästarstuderande Dag Lindgren 2003: Genetic diversity
Genetic diversity and seed orchards – yesterday and tomorrow – pros and cons.  Föreläsning om genetisk diversitet från Skövde Högskola
Wibeck 1911    Utländska gran- och tallprovenienser i svenskt skogsbruk Mats Hannerz och Anders Almäng, 1997
Skrøppa, T. (red.) 1996. Genetisk diversitet i foryngelsematerialer. Nordisk seminar holdt på Honne Konferansesenter, Biri, for Nordisk Skogbruks Frø- og Planteråd 14.-15. november 1995. Aktuelt fra Skogforsk 11/96: 21 s.
Lindgren D. 1998. Balansen mellan produktion och genetisk mångfald. (In Swedish) Skogsfakta, 7 1998.
Ekologisk utvärdering av klonskogsbruk, fungerar som MKB för klonskogsbruk även om termen kanske inte definieras exakt likadant över tiden. Den version som ligger på denna web är ett manuskript, den slutliga versionen är: Sonesson, J, Bradshaw, R, Lindgren D & Ståhl P 2001 Ecological evaluation of clonal forestry with cutting-propagated Norway spruce.  SkogForsk Report 1: 59 pages.
Dag Lindgren har nyligen gjort en frötäktsutredning. Specifikt finns ett dokument om genetisk diversitet och ett dokument om skogshistoria som nu successivt modifieras så att de blir underbilagor (för mycket detaljer för att vara i huvuddokumentet)
http://www.skogforsk.se/templates/sf_NewsPage____2966.aspx?sm=1&cpi=2170&ci=7Naturvårdsverket och forskning i anslutning till denna om tex genetiska variation och dess struktur.
Strategi för främmande arter och genotyper
Laikre, L., Palmé, A., Larsson, L.C. och Lindberg, E. (redaktörer) (2007). Spridning av genetiskt främmande populationer i Sverige. Vad vet vi? Vad gör vi? Vilka är effekterna?  Naturvårdsverkets rapport 5683.
Laikre, L. & Palmé, A  2005. Spridning av främmande populationer i Sverige.   Naturvårdsverkets rapport 5475.
http://www.naturvardsverket.se/Documents/publikationer/620-5475-9.pdf
Linda Laikre · Lena C. Larsson · Anna Palmé ·Johan Charlier · Melanie Josefsson · Nils Ryman Biodivers Conserv (2008) 17:893–910  Frågan om bättre registrering har varit aktuell under ett sekel, ett exempel : http://rixlex.riksdagen.se/Webbnav/index.aspx?nid=410&dok_id=GH02Jo308
Skogsstyrelsen 2009. Regler om användning av främmande trädslag. Meddelande 2009-7

B Karlsson: Granens genetik...   Granens historia i sydsverige
Provenienshybrider av gran
Seed transfer in Europe, föredrag mars 2009 av Heino Wolf baserat på en enkät i EU

Länkar från svensk relevant miljödebatt:
http://www.dn.se/DNet/jsp/polopoly.jsp?d=572&a=760542
http://miljodebatt.wordpress.com/2008/04/14/vet-vetenskapsmannen-alltid-vad-de-pratar-om/

Genetisk variation har också varit en politisk drivkraft http://www.svd.se/kulturnoje/understrecket/artikel_2130645.svd

Tidplan
Uppdraget till regeringen skall rapporteras till Formas 10-02-28 för vidare befordran till regeringen. Det var inte möjligt att samla referensgruppen förrän efter fyra månader och mycket mer kan inte göras före referensgruppsammanträdet och sedan är det sommar och jag ville inte ha sommaren blockerad och hade program till första veckan i oktober. Jag pensionerades 090930 och visste inte precis hur jag reagerade på att bli emeritus. Vad jag inte visste var att min hälsa skulle försämras efter pensioneringen vilket fördröjt arbetet. Min avsikt är inte att det skall bli ett tvärstopp utan att jag skall fullfölja till ett läsbart dokument till jul. Jag började enligt instruktioner från Skogforsk att arbeta med det här ca 081110, Skogforsk ville inte fördröja struktureringen av arbetet, men jag ville inte göra för mycket innan referensgrupp givit synpunkter. Regeringen gav inte uppdraget direkt utan via FORMAS, formellt klartecken från Skogforsk nådde mig först 081216 och det formella tillsättandet av en referensgrupp blev klart 090106 och sedan visade det inte möjligt att arbeta som jag tänkt elektroniskt utan det måste vara ett fysiskt sammanträde och det gick inte att ordna förrän 11 maj. Jag vill inte göra för mycket innan referensgruppens synpunkter och ett diskussionsprotokoll förelåg. Sedan vill jag nu har ordentliga sommarferier och gör ganska lite före 7e oktober. Jag skall försöka få slutdokumentet läsbart till Skogforsk före jul och därefter kommer väl en del editeringar. Denna web kommer att finnas kvar, men texten kommer inte att vara helt aktuell från ca 091220 eftersom utredningen bör ha formen av ett mer enhetligt dokument ¨än vad som presenteras här. Den färdiga "utredningen" kommer att anslås här, men troligen först när den faktiskt är färdig.

Föredragning på CFOP 091125  Minnesanteckningar

Slutdokument
Titeln kan vara: "Effekter av ökad användning av förädlat plantmaterial på genetisk variation och känslighet för skadegörare." På svenska och allmänt tillängligt på webben som rapport. Dokumentet skall ha drag av MKB för skogsträdsförädling. Om inte annat så kan det vara en rapport permanent tillgänglig på SLUs epsilon-web (Skogforsk säljer sina rapporter, vilket gör dem praktiskt svårtillängliga, och även om de så vore gratis så blir de tillgängligare om de finns på nätet också. Förmodligen är det bäst om det finns både på papper och nät.). Dokumentet kanske kan göras tillängligt från Kunskap direkt. Det kanske aktualiseras med sammanfattningar.

Webplats
Min avsikt är att denna webplats för genetisk variation skall kvarstå och utvecklas och att jag skall underhålla den en tid även efter våren 2010. Existensen av en websammanställning  underlättar för dem som i framtiden vill sätta sig in i frågorna. Den som önskar kan få utrymme eller saker införda på webben (kanske ett underdokument eller en föredragning på powerpoint) kan höra av sig. Till början av 2010 reflekterar dock denna web med undersidor mest ett pågående arbete, och bör behandlas som ett ofärdigt arbetsdokument.

Blogg
Om jag får kvalificerade relevanta inlägg som jag inte vet hur jag skall skriva in eller inte passar för att skriva in direkt placerar jag dem här. I mitten på juni hade ett inlägg kommit.(liknande finns på http://www.tores.se/toretank/regeringens-fraga-till-skogsbruket

Minnesanteckningar
Danell Ö 1992. Genetisk variation på olika sätt. Skog o Forskning 1/92:28-44.

Sammanträde: Det var ett sammanträde på Arlanda 090511.med bl a referensgruppen till denna utredning. Beskrivning
Innehållet 090505 hopslaget i en .pdf fil  Min föredragning läggs ut här.

Senast redigerat av Dag Lindgren 100211